Die Angewandte Ökologie & Phykologie teilt sich mit der AG Ökologie und der AG Zellbiologie phototropher mariner Organismen das Mikroskopielabor. Jun.-Prof. Dr. Klaus Herburger (AG Zellbiologiephototropher mariner Organismen) ist ein Experte für zellbiologische Untersuchungen und viele verschiedene mikroskopische Techniken (z.B. Elektronenmikroskopie, konfokale Laser-Scanning-Mikroskopie...).Die Olympus-Mikroskope BX-51 und IX-70 sind mit differentiellem Interferenzkontrast ausgestattet, der die Visualisierung auch von sehr kleinen Zellen und Zellbestandteilen ermöglicht. Die maximale Vergrößerung beträgt 1000-fach. Das Inversmikroskop IX-70 bietet die Möglichkeit auch Oberflächen größerer Objekte zu untersuchen (z.B. Aufwuchs auf Dachziegeln). Die Mikroskopiebilder können durch eine Kamera und Imaging-Software aufgenommen, ausgewertet und gespeichert werden. Die Lichtmikroskopie wird insbesondere für die morphologische Bestimmung lebender Algen und Schalenpräparaten von Diatomeen genutzt.

BORCHHARDT, N., SCHIEFELBEIN, U., ABARCA, N., BOY, J., MIKHAILYUK, T., SIPMAN, H. & KARSTEN, U. (2017) Diversity of algae and lichens in biological soil crusts of Ardley and King George Island, Antarctica. Antarctic Science 29, 229-237. DOI: 10.1017/S0954102016000638

ALBRECHT, M., PRÖSCHOLD, T. & SCHUMANN, R. (2017) Identification of cyanobacteria in a eutrophic coastal lagoon on the southern Baltic coast. Frontiers in Microbiology 8, 923. DOI: 10.3389/fmicb.2017.00923

SCHULZ, K., MIKHAILYUK, T., DRESSLER, M., LEINWEBER, P. & KARSTEN, U. (2016) Biological soil crusts from coastal dunes at the Baltic Sea: cyanobacterial and algal biodiversity and related soil properties. Microbial Ecology 71, 178-193. DOI: 10.1007/s00248-015-0691-7

Die beiden Lichtmikroskope BX-51 und IX-70 (siehe Lichtmikroskopie) sind mit Epifluoreszenzeinheiten ausgestattet, die Anregungslicht im grünen, blauen und UV-Spektrum ermöglichen. Dadurch können verschiedene Fluorophore genutzt werden. Häufige Anwendung finden DAPI-, FITC- und Autofluoreszenzanalysen.

GLADIS, F. & SCHUMANN, R. (2011) A suggested standardised method for testing photocatalytic inactivation of aeroterrestrial algal growth on TiO₂-coated glass. International Biodeterioration & Biodegradation 65, 415-422. DOI: 10.1016/j.ibiod.2011.01.005

Des Weiteren verfügt die Arbeitsgruppe über ein Leica-Stereomikroskop mit einer maximalen Vergrößerung von 64-fach um größere Objekte wie Muschelbohrlöcher in Holzplatten abzubilden. Auch das Stereomikroskop ist mit einer Imaging-Software verbunden.

WEIGELT, R., LIPPERT, H., BORGES, L., APPELQVIST, C., KARSTEN, U. & BASTROP, R. (2016) First time DNA barcoding of the common shipworm Teredo navalis Linnaeus 1758 (Mollusca: Bivalvia: Teredinidae): molecular-taxonomic investigation and identification of a widespread wood-borer. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology 475, 154-162. DOI: 10.1016/j.jembe.2015.11.008

Weitere, kleinere Mikroskope, sowie Stereomikroskope stehen in den Labors zur Verfügung.